MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 68347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_017167	CG	3	6	127008	127013	0 %	0 %	50 %	50 %	384133907
3003	NC_017167	TCC	2	6	127022	127027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384133907
3004	NC_017167	CGC	2	6	127056	127061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133907
3005	NC_017167	CCG	2	6	127062	127067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133907
3006	NC_017167	AGC	2	6	127175	127180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133907
3007	NC_017167	CACG	2	8	127218	127225	25 %	0 %	25 %	50 %	384133907
3008	NC_017167	CG	4	8	127224	127231	0 %	0 %	50 %	50 %	384133907
3009	NC_017167	TC	3	6	127242	127247	0 %	50 %	0 %	50 %	384133907
3010	NC_017167	CAGG	2	8	127248	127255	25 %	0 %	50 %	25 %	384133907
3011	NC_017167	TCG	2	6	127265	127270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133907
3012	NC_017167	ATG	2	6	127337	127342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133907
3013	NC_017167	CCG	2	6	127421	127426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133907
3014	NC_017167	CCG	2	6	127437	127442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133907
3015	NC_017167	CTTC	2	8	127470	127477	0 %	50 %	0 %	50 %	384133907
3016	NC_017167	AGA	2	6	127488	127493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133907
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3018	NC_017167	GTG	2	6	127594	127599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133907
3019	NC_017167	TGC	2	6	127602	127607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133907
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3022	NC_017167	TAG	2	6	127739	127744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133907
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3030	NC_017167	GAG	2	6	127948	127953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133907
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3032	NC_017167	GAG	2	6	128077	128082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133907
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3041	NC_017167	CG	3	6	128487	128492	0 %	0 %	50 %	50 %	384133907
3042	NC_017167	CGATGT	2	12	128520	128531	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384133907
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3044	NC_017167	CAGC	2	8	128561	128568	25 %	0 %	25 %	50 %	384133907
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3047	NC_017167	TCG	2	6	128681	128686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3052	NC_017167	GGC	2	6	129077	129082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133909
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3056	NC_017167	TCG	2	6	129181	129186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133909
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3058	NC_017167	GAG	2	6	129252	129257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133909
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3063	NC_017167	AGGG	2	8	129391	129398	25 %	0 %	75 %	0 %	384133909
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3069	NC_017167	ACG	2	6	129650	129655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3071	NC_017167	AGC	2	6	129777	129782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3093	NC_017167	CGA	2	6	130509	130514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133910
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3102	NC_017167	GGCG	3	12	130791	130802	0 %	0 %	75 %	25 %	384133910
3103	NC_017167	TCGCGC	2	12	130812	130823	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384133910
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3105	NC_017167	TAC	2	6	130876	130881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133910
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3107	NC_017167	ACG	2	6	131011	131016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133910
3108	NC_017167	TCG	2	6	131044	131049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133910
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3119	NC_017167	AGA	2	6	131463	131468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133911
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3123	NC_017167	GGC	2	6	131570	131575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133911
3124	NC_017167	GCG	2	6	131578	131583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133911
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3127	NC_017167	CGA	2	6	131671	131676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133911
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3129	NC_017167	CG	3	6	131774	131779	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3132	NC_017167	CGC	2	6	132171	132176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133912
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3221	NC_017167	GTCG	2	8	135917	135924	0 %	25 %	50 %	25 %	384133916
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3230	NC_017167	TCA	2	6	136365	136370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133916
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3233	NC_017167	TCC	2	6	136410	136415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384133916
3234	NC_017167	AAC	2	6	136428	136433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384133916
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3236	NC_017167	TGC	2	6	136611	136616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133916
3237	NC_017167	TGGA	2	8	136668	136675	25 %	25 %	50 %	0 %	384133916
3238	NC_017167	GAC	2	6	136678	136683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133916
3239	NC_017167	GCT	2	6	136762	136767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133916
3240	NC_017167	GTC	2	6	136907	136912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3241	NC_017167	CTCG	2	8	136931	136938	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3242	NC_017167	TAG	2	6	137017	137022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3243	NC_017167	ACC	2	6	137069	137074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3244	NC_017167	TTG	2	6	137190	137195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384133917
3245	NC_017167	TGAC	2	8	137291	137298	25 %	25 %	25 %	25 %	384133917
3246	NC_017167	CGA	2	6	137311	137316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133917
3247	NC_017167	GGC	2	6	137334	137339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133917
3248	NC_017167	CGC	2	6	137376	137381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133917
3249	NC_017167	GATC	2	8	137463	137470	25 %	25 %	25 %	25 %	384133917
3250	NC_017167	GCG	2	6	137484	137489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133917
3251	NC_017167	GAG	2	6	137504	137509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133917
3252	NC_017167	CACCAT	2	12	137530	137541	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384133917
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3263	NC_017167	CCT	2	6	137967	137972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384133917
3264	NC_017167	ATC	2	6	138020	138025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133917
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3324	NC_017167	AGAGG	2	10	141049	141058	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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3330	NC_017167	AAG	2	6	141222	141227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3333	NC_017167	GCAA	2	8	141317	141324	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3337	NC_017167	TG	3	6	141755	141760	0 %	50 %	50 %	0 %	384133923
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3341	NC_017167	AAT	2	6	141903	141908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3342	NC_017167	ATG	2	6	141997	142002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3344	NC_017167	GAT	2	6	142062	142067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3349	NC_017167	ATCG	2	8	142627	142634	25 %	25 %	25 %	25 %	384133925
3350	NC_017167	A	6	6	142655	142660	100 %	0 %	0 %	0 %	384133925
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3361	NC_017167	AGA	2	6	143484	143489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133925
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3364	NC_017167	GAGAT	2	10	143621	143630	40 %	20 %	40 %	0 %	384133925
3365	NC_017167	AAC	2	6	143662	143667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384133925
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3490	NC_017167	TTTC	2	8	150033	150040	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3491	NC_017167	ACC	2	6	150142	150147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3492	NC_017167	ATT	2	6	150181	150186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3493	NC_017167	TTG	2	6	150325	150330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3494	NC_017167	TTCGA	2	10	150400	150409	20 %	40 %	20 %	20 %	384133931
3495	NC_017167	GTC	2	6	150457	150462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133931
3496	NC_017167	TGA	2	6	150491	150496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133931
3497	NC_017167	GAT	2	6	150560	150565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133931
3498	NC_017167	GCA	2	6	150617	150622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133931
3499	NC_017167	ACC	2	6	150663	150668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384133931
3500	NC_017167	GAA	2	6	150681	150686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133931

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